Rektor UPJPII, ks. prof. dr hab. Robert Tyrała, przed rozpoczęciem Eucharystii, witając jej uczestników, przypomniał w swoim wystąpieniu długą i bogatą historię krakowskiej teologii akademickiej. Podkreślił, że jej początki sięgają bulli papieża Bonifacego IX z 1397 roku, wydanej na prośbę św. królowej Jadwigi, która doprowadziła do powołania Wydziału Teologicznego w Krakowie. Po trudnych wydarzeniach roku 1954 i późniejszym utworzeniu Papieskiego Wydziału Teologicznego, 8 grudnia 1981 roku, papież Jan Paweł II powołał do istnienia Papieską Akademię Teologiczną w Krakowie. Składała się ona z trzech wydziałów i została obdarzona pełnią praw oraz obowiązków właściwych kościelnym uczelniom.
Rektor przypomniał również, że ostatnim etapem tej historycznej drogi było ustanowienie w 2009 roku przez papieża Benedykta XVI Uniwersytetu Papieskiego Jana Pawła II w Krakowie – aktu dokonanego ku czci jego wielkiego poprzednika. Wskazał też na najnowszy rozdział dziejów uczelni – ukończenie drugiej części budowy kampusu UPJPII.
W wystąpieniu podkreślił symboliczne znaczenie kościoła św. Marka, gdzie odbywała się uroczystość. To właśnie to miejsce stanowi historyczny punkt odniesienia dla krakowskiej teologii i współczesnego uniwersytetu.
Rektor wyraził wdzięczność bp. Kazimierzowi Górnemu, który przewodniczył modlitwie. Przypomniał jego wieloletnią więź z Papieską Akademią Teologiczną, zaangażowanie w życie Kościoła oraz troskę o relację między wiarą a rozumem. Podziękował także ks. prof. Adamowi Kubisiowi, rektorowi rzeszowskiego seminarium, za przygotowanie homilii.
Ciepłe słowa powitania skierował również do bp. prof. Jana Kopca, doktora honoris causa UPJPII, znanego pasterza i znawcy historii.
Na zakończenie Rektor poprosił o modlitwę za wszystkich, którzy przez wieki tworzyli Papieską Akademię Teologiczną i dzisiejszy Uniwersytet – profesorów, pracowników i studentów. Zawierzył wspólnotę akademicką wstawiennictwu św. Jadwigi, bł. Michała Giedroycia oraz św. Jana Pawła II, patrona współczesnych dziejów uczelni.
Ks. prof. Adam Kubiś, rektor Wyższego Seminarium Duchownego w Rzeszowie mówił w swojej homilii o trzech etapach Bożego planu wobec człowieka: stworzeniu, odkupieniu i naszym osobistym powrocie do Boga. Najpierw przypomniał raj jako pierwotną świątynię, w której człowiek żył w bliskości i przyjaźni z Bogiem, zanim nastąpiło nieposłuszeństwo i wyjście z Edenu. Następnie ukazał Maryję jako Nową Ewę – tę, przez którą Bóg rozpoczyna odnowienie ludzkości, a jej postawa fiat staje się wzorem powrotu do raju. Trzecim etapem jest nasze własne przemienienie – dzięki mocy Ducha Świętego każdy z nas ma stawać się świątynią Boga, arką Jego obecności, jaśniejąc Jego chwałą. Kaznodzieja podkreślał, że drogą do tego jest posłuszeństwo woli Bożej – jedyny prawdziwy dar, jaki człowiek może ofiarować Bogu i dzięki któremu staje się częścią Bożej rodziny.
Biskup Kazimierz Górny, który przewodniczył tej Mszy św. podzielił się wdzięcznością za możliwość sprawowania jej w kościele św. Marka oraz za spotkanie z obecnymi. Wspominał ponad trzy dekady swojej posługi w diecezji krakowskiej, z ciepłem wracając pamięcią do czasu pracy w Krakowie. W swoim wystąpieniu podkreślił historyczną rolę miasta, przypominając słowa „Cracovia urbsceleberrima” (Kraków, miasto najwspanialsze) i zaznaczając, że przez wieki było „obrońcą prawdy” i miejscem tworzącym duchową atmosferę wpływającą na całą ojczyznę.
Zwracając się do księży profesorów, życzył im, by pamiętali o dziedzictwie Uniwersytetu Krakowskiego i jego teologicznego wydziału, który „zawsze spełniał wspaniałą rolę”. Zachęcał ich, by byli głosicielami i obrońcami prawdy — zarówno tej teologicznej, jak i tej dotyczącej historii oraz losów Polski. Biskuppowierzył wszystkich obecnych opiece Matki Najświętszej, św. Jadwigi i św. Jana Pawła II, prosząc, aby wypraszali im potrzebne łaski. Życzył uczestnikom wszelkiego dobra i udzielił pasterskiego błogosławieństwa.
Po zakończonej Eucharystii wręczone zostały Medale „Zasłużony dla Uniwersytetu Papieskiego Jana Pawła II w Krakowie”. Otrzymali je: dr Tibor Gerencser, bp prof. Jan Kopiec, Franciszek Motyka i prof. Jacek Urban.
Wręczono także nagrody rektora za osiągnięcia w pracy naukowo-dydaktycznej i organizacyjnej w minionym roku akademickim. Nagrodą rektora wyróżnieni zostali także pracownicy administracji i biblioteki. Wręczone zostały dyplomy pracownikom, którym przyznano jednorazowe premie uznaniowe oraz za wysiłek i wyjątkowe zaangażowanie w proces inwestycyjny Kampusu Jana Pawła II.
Uhonorowano nagrodą rektora autorów najlepszych prac doktorskich, magisterskich i licencjackich zawodowych.
Tytuł Studenta Roku UPJPII w edycji 2025 r. otrzymali: Grzegorz Płaza – student historii, prezes Koła Naukowego „Phronesis”, koordynator Regionalnego Ośrodka Debaty Międzynarodowej. Aktywnie uczestniczący również w projektach badawczych Instytutu Badań nad Turcją oraz w inicjatywach o zasięgu ogólnopolskim i międzynarodowym. Zaangażowany w organizację konferencji, seminariów, projektów edukacyjnych i naukowych. Sławomir Dębski – student psychologii, przewodniczący sekcji psychoanalitycznej Koła Naukowego „Psyche”, współorganizator konferencji naukowych, a także reprezentant UPJPII w zawodach siatkarskich. Poza uniwersytetem działa jako wolontariusz w stowarzyszeniu „Nadzieja” oraz Wspólnocie Wiara i Światło “Milusińscy”. Natalia Maśnik – studentka digital media, aktywnie działająca w obszarze organizacji wydarzeń kulturalnych i społecznych, prowadząca różnego rodzaju projekty, włączająca się w wolontariaty oraz angażująca się w liczne inicjatywy na uczelni i poza nią. Rozwija kompetencje poprzez pracę w redakcji uniwersyteckiej, kołach naukowych, Inkubatorze Kulturalnym oraz współpracuje z agencją eventową a także tytuł Honorowego Studenta Roku UPJPII otrzymał Marek Grela, za całokształt pracy na rzecz społeczności uczelni i nieoceniony wkład w działalność Samorządu Studenckiego.
