Powstanie dodatkowe, prawie 100-metrowe przejście podziemne po zachodniej stronie stacji Warszawa Gdańska - w kierunku ulicy Kłopot. Według kolejarzy zapewni lepszy dostęp na perony oraz do komunikacji miejskiej, w tym metra. Na perony 2, 3 oraz 4 będą prowadzić schody ruchome oraz tradycyjne. Dostępność dla osób o ograniczonych możliwościach poruszania się zapewnią windy. Do nowego tunelu zaplanowano wejście od strony Żoliborza z ulicy Księdza Romana Indrzejczyka, które wyposażone zostanie w schody oraz windę. Po drugiej stronie stacji tunel zostanie połączony z dotychczasowym przejściem podziemnym prowadzącym do budynku dworca oraz metra.
Dla podróżnych zaplanowano też nowe zadaszenie na wszystkich peronach. Długie wiaty – znane między innymi z linii obwodowej – ochronią przed zmiennymi warunkami atmosferycznymi podczas oczekiwania na pociąg. PKP Polskie Linie Kolejowe S.A. rozpisały przetarg na zaprojektowanie i wykonanie robót budowlanych. Zakończenie prac planowane jest w drugiej połowie 2025 roku.
